Η ειδική διάγνωση της ηπατίτιδας D βασίζεται στην ανίχνευση δεικτών ενεργού αναδιπλασιασμού και των δύο ιών: HBV, HDV. Από τις πρώτες ημέρες του ίκτερου, ανιχνεύονται στον ορό του αίματος HBsAg, αντι-HBV IgM σε υψηλό τίτλο, αντιγόνο HBe, HDAg ή/και αντι-δέλτα (αντι-δέλτα IgM). Τα αντι-δέλτα IgM παράγονται ήδη στην οξεία περίοδο και χρησιμεύουν ως ο κύριος δείκτης της δέλτα λοίμωξης.