Τα συμπτώματα του φαρυγγοεπιπεφυκτικού πυρετού είναι ποικίλα: μπορεί να εκδηλωθεί κυρίως ως καταρροή της ανώτερης αναπνευστικής οδού (οξεία ρινίτιδα, οξεία διάχυτη καταρροϊκή φαρυγγίτιδα, οξεία λαρυγγίτιδα και τραχειίτιδα), επιπεφυκίτιδα (καταρροϊκή, θυλακοειδής, μεμβρανώδης), κερατοεπιπεφυκίτιδα, φαρυγγοεπιπεφυκίτιδα.