Η διάγνωση της οπιστορχίασης βασίζεται σε κλινικά, επιδημιολογικά και εργαστηριακά δεδομένα: κατανάλωση θερμικά μη επεξεργασμένων, ελαφρώς αλατισμένων ψαριών σε ενδημικές περιοχές, πυρετός, τοξικοαλλεργικό σύνδρομο, λευκοκυττάρωση και ηωσινοφιλία στο αίμα, στη χρόνια φάση - συμπτώματα χολοκυστοπαγκρεατίτιδας, γαστροδωδεκαδακτυλίτιδας.