Η ενσωμάτωση του RNA του ξενιστή σχετίζεται με τη χρόνια λοίμωξη από ηπατίτιδα Ε

Εάν ο ιός ενσωματώσει τμήματα του γονιδιώματος του ξενιστή στη γενετική του δομή, η λοίμωξη μπορεί να γίνει χρόνια.

• Γιατί η ηπατίτιδα Ε γίνεται χρόνια σε ορισμένους ασθενείς και γιατί τα φάρμακα δεν λειτουργούν;

Για να το διαπιστώσει, μια διεθνής ομάδα ερευνητών με επικεφαλής επιστήμονες από το Μπόχουμ παρατήρησε έναν ασθενή με χρόνια λοίμωξη από ηπατίτιδα Ε για ένα χρόνο. Η επαναληπτική αλληλούχιση του ιικού RNA έδειξε ότι ο ιός είχε ενσωματώσει διάφορα μέρη του mRNA του ξενιστή στο γονιδίωμά του. Αυτό είχε ως αποτέλεσμα ένα πλεονέκτημα αντιγραφής, το οποίο θα μπορούσε να συμβάλει στη χρονιότητα της λοίμωξης.

• Η ενσωμάτωση RNA ξενιστή μπορεί να προβλέψει τη μετάβαση από οξεία λοίμωξη σε χρόνια κατάσταση

Δρ. Ντάνιελ Τοντ, Επικεφαλής της Ερευνητικής Ομάδας Υπολογιστικής Ιολογίας, Τμήμα Ιατρικής και Μοριακής Ιολογίας, Πανεπιστήμιο Ρουρ-Μπόχουμ, Γερμανία

Οι ερευνητές ανέφεραν αυτό στο περιοδικό Nature Communications.

• Αλληλούχιση του ιικού πληθυσμού

Κάθε χρόνο, περίπου 20 εκατομμύρια άνθρωποι παγκοσμίως μολύνονται από ηπατίτιδα Ε. Η λοίμωξη συνήθως περνάει χωρίς συνέπειες, αλλά μπορεί να είναι απειλητική για τη ζωή των εγκύων ή των ατόμων με εξασθενημένο ανοσοποιητικό σύστημα. Σε ορισμένες περιπτώσεις, γίνεται χρόνια. Δεν υπάρχουν συγκεκριμένα αποτελεσματικά φάρμακα. Το ευρέως φάσματος αντιιικό φάρμακο ριμπαβιρίνη χρησιμοποιείται επίσης κατά της ηπατίτιδας Ε, αλλά δεν λειτουργεί πάντα.

• Πώς διαφεύγει ο ιός από το ανοσοποιητικό σύστημα; Γιατί η λοίμωξη γίνεται χρόνια και δεν υποχωρεί;

Για πρώτη φορά, οι ερευνητές ανέλυσαν ολόκληρο τον ιικό πληθυσμό ενός ασθενούς με χρόνια λοίμωξη για περισσότερο από ένα χρόνο. Εξέτασαν λεπτομερώς περισσότερες από 180 μεμονωμένες αλληλουχίες από δείγματα αίματος.

• Αντιγραφή σε κυτταροκαλλιέργεια χρησιμοποιώντας RNA ξενιστή

«Ο ιός της ηπατίτιδας Ε έχει μια λεγόμενη υπερμεταβλητή περιοχή στις γενετικές του πληροφορίες, στην οποία μπορεί να ενσωματώσει διαφορετικές αλληλουχίες RNA από τα κύτταρα ξενιστή», εξηγεί ο Daniel Todt. Η ομάδα του μπόρεσε να δείξει ότι η σύνθεση αυτής της περιοχής άλλαξε σημαντικά κατά την περίοδο παρατήρησης. Επιπλέον, προέκυψαν πολλές διαφορετικές συνθέσεις ταυτόχρονα. Σε πειράματα κυτταροκαλλιέργειας, αποδείχθηκε ότι η ενσωμάτωση RNA ξενιστή παρείχε ένα πλεονέκτημα αντιγραφής: οι τροποποιημένοι ιοί ήταν σε θέση να αναπαραχθούν καλύτερα από άλλους. «Υποθέτουμε ότι αυτό ευθύνεται εν μέρει για τη χρονιότητα της λοίμωξης και την αποτυχία της θεραπείας», λέει ο Daniel Todt.

• Μελέτη του RNA του ξενιστή που ενσωματώνεται στον ιό

Οι ερευνητές ανέλυσαν τη σύνθεση του RNA του ξενιστή που ενσωματώθηκε στον ιό για να προσδιορίσουν εάν υπήρχαν κοινά χαρακτηριστικά που χαρακτήριζαν τα γενετικά τμήματα. «Ωστόσο, δεν μπορέσαμε να βρούμε σημαντικές ομοιότητες», λέει ο Todt. Οι αλληλουχίες γονιδίων που ενσωματώθηκαν ήταν ως επί το πλείστον αυτές που είναι πολύ κοινές στα κύτταρα ξενιστή, γεγονός που υποδηλώνει τυχαία επιλογή.

• «Είναι πιθανό ότι όταν υπάρχει λοίμωξη από ηπατίτιδα Ε, υπάρχει ένας ανταγωνισμός μεταξύ του ιού και του ανοσοποιητικού συστήματος στο σώμα», προτείνει ο Daniel Todt.

Εάν ο ιός καταφέρει να ενσωματώσει το RNA του ξενιστή πριν το ανοσοποιητικό σύστημα καταπολεμήσει με επιτυχία τη λοίμωξη, μπορεί να οδηγήσει σε χρονιότητα. «Το RNA του ξενιστή στο ιικό γονιδίωμα μπορεί, σε κάθε περίπτωση, να χρησιμεύσει ως βιοδείκτης στην οξεία φάση της λοίμωξης, υποδεικνύοντας μια πρώιμη πιθανότητα χρονιότητας».

• Σχεδιασμός περαιτέρω έρευνας

Οι ερευνητές σχεδιάζουν να επεκτείνουν τις μελέτες τους σε μεγαλύτερες ομάδες ασθενών.