Η εγκεφαλίτιδα στην ανεμοβλογιά είναι μια σοβαρή λοιμώδης-αλλεργική ασθένεια. Η εγκεφαλίτιδα στην ανεμοβλογιά αναπτύσσεται την 3η-7η ημέρα μετά την εμφάνιση του εξανθήματος. Σπάνια, η εγκεφαλίτιδα εμφανίζεται αργότερα ή στην προ-εξανθηματική περίοδο. Εμφανίζονται υπερθερμία, κωματώδης κατάσταση, σπασμοί, μηνιγγικά συμπτώματα, πυραμιδικές και εξωπυραμιδικές διαταραχές.