Η κροτωνογενής εγκεφαλίτιδα προκαλείται από έναν φλαβοϊό, που μεταδίδεται από κρότωνες ixodid, και έχουν περιγραφεί περιπτώσεις μόλυνσης μέσω φρέσκου γάλακτος. Μετά από 10ήμερη περίοδο επώασης, εκδηλώνεται ως καταρροή, πυρετός, πονοκέφαλος, πόνος στις αρθρώσεις και αλλοιώσεις του ΚΝΣ (εγκεφαλίτιδα - 30%, μηνιγγίτιδα - 60%, μηνιγγοεγκεφαλίτιδα - 10%). Ο εμβολιασμός κατά της κροτωνογενούς εγκεφαλίτιδας σε ενδημικές περιοχές έχει οδηγήσει σε μείωση της συχνότητας εμφάνισης.