Ο προσδιορισμός αντισωμάτων στο μικροσωμικό κλάσμα του θυρεοειδούς αδένα χρησιμοποιείται για τη διάγνωση της αυτοάνοσης θυρεοειδίτιδας και του υποθυρεοειδισμού, στους οποίους αυξάνεται το επίπεδο αντισωμάτων στο αίμα. Τα αντισώματα στα μικροσώματα του θυρεοειδούς σχηματίζουν ανοσοσυμπλέγματα στην επιφάνεια των κυττάρων, ενεργοποιούν τα λεμφοκύτταρα του συμπληρώματος και τα κυτταροτοξικά λεμφοκύτταρα, γεγονός που οδηγεί σε καταστροφή των κυττάρων και στο σχηματισμό μιας φλεγμονώδους διαδικασίας στον θυρεοειδή αδένα.