Η μαγνητική τομογραφία της κροταφογναθικής άρθρωσης είναι μια πολλά υποσχόμενη μέθοδος για τη διάγνωση διαταραχών της κινητικής λειτουργίας των κρανιακών οστών. Επιτρέπει σε κάποιον να αξιολογήσει γρήγορα, χωρίς να παραβιάσει την ακεραιότητα των μαλακών ιστών, τα ανατομικά χαρακτηριστικά και τις πιθανές βλάβες στα οστά της άρθρωσης, την εννεύρωσή της, την κατάσταση των μυών του προσώπου, παρέχοντας στον γιατρό σημαντικές πληροφορίες για την ακριβή διάγνωση.